Η αμνιοπαρακέντηση ή αμνιοκέντηση προτείνεται όταν η στατιστική πιθανότητα για το σύνδρομο Down που προκύπτει από το υπερηχογράφημα Β΄τριμήνου είναι αυξημένη ή όταν υπάρχουν υπερηχογραφικά ευρήματα που απαιτούν περαιτέρω διερεύνηση. Συνήθως γίνεται όταν οι μέλλουσες μητέρες είναι πάνω από 35 ετών ή όταν έχουν ήδη ένα παιδί με χρωμοσωμικές ανωμαλίες.